鐮倉時代（1185-1333），禪宗東傳日本。由于我國的大乘釋教強力制止食肉，因而，來歷于“不殺生”的釋教思維的素齋“精進照料”也隨禪宗一道自我國傳入日本，并得到長足開展。也正是在精進照料盛行的這一時期，我國的豆腐傳入日本。

農耕的呈現（繩文時代初期，距今約1萬4千年前），標志著古日自己食物獲取辦法的改變。前期農耕以散作栽培雜谷、薯類等食物為代表，繩文時代晚期，水田耕耘辦法經由朝鮮半島傳入日本。由于水田耕耘的效率高，加之其產品——大米的養分價值高、易儲存等長處，水田耕耘在日本本鄉廣泛傳播開來。進入彌生時代（前400），日本現已構成了定型的水田耕耘辦法，這也標志著日本進入了以稻米為首要食材質料的時代。

納豆飯，相同也是一個在日本眾所周知、在其他國家卻難以承受的食物。納豆是一種傳統發酵食物，它氣味濃郁，有黏性。食用辦法是先將其拌和至絲狀物呈現，再加上醬油或芥末，置于白飯上食用，是為納豆飯。也有人將納豆和生雞蛋、蔥、蘿卜、柴魚等各種食材一同混合，北海道等當地則會將納豆和砂糖混合，現在也盛行加上美乃滋（蛋黃醬）的構思吃法。但無論是蔥、芥末仍是大蒜，都是為了按捺“納豆氨”沖鼻的氣味。因而，雖然納豆富含維生素K2、具有溶解體內纖維蛋白的保健作用，但沖鼻氨氣味卻導致它的口碑呈現了顯著的兩極分化。

在日本菜中，還有聞名的“昆蟲飲食”，其間，蝗蟲是最受歡迎的。依據昆蟲學家三宅恒方在1919年編撰的一份陳述，超越50%的日本大眾食用昆蟲。在那個時代，不僅是蝗蟲，還有蜜蜂幼蟲、蠶蛹、長角甲蟲、巨型水蝽等55種昆蟲被吃掉。